Нет, их нельзя судить отдельно друг от друга, потому как второй сезон прямое продолжение первого (капитан), продолжение жизни и приключений Кирито, его друзей. Жаль, но мангака не смог придумать лучшего продолжения САО, а ведь проект был отлично воспринят во всем аниме - мире.
Дальше будет пара спойлеров.
Первая половина САО была великолепна, а эта передача атмосферы мира взаперти, где смерть поджидает героев на каждом углу, шикарна. Вторая часть логично продолжает первую и заканчивает её: есть другой виртуальный мир, в котором отбитый псих - глава корпорации (или не глава, не суть), воспользовавшись поражением предыдущего злодея, вылавливает часть людей из разрушенного мира и проводит свои опыты на них, да еще и попутно захватывает подружку ГГ. Разумеется, герой должен её спасти, чем и занимается оставшиеся серии. В конце все спасены, хорошие ребята празднуют победу, плохие же в полной заднице. Поделом, ггвп. На этом и стоило закончить, но нет, надо высосать из людей больше денег, выпустив еще 10 томов ранобе, попутно загубив всю так хорошо начавшуюся историю.